אך זה הגיוני ששתי גופים ששונים במסה שלהם יפעילו את אותו כוח זה כנגד זה?

הם מפעילים אותו כוח (אינטרקציה!) אבל ההשפעה לא תהיה זהה.
לדוגמא-אם כדור נייר מתנגש בכדור באולינג-הם יפילו את אותו כוח אחד על השני, אבל כדור הנייר ימעך ולכדור הבאולינג לא יקרה כלום.

זה הגיוני מבחינה פיזיקלית אבל אם מנסים לדמיין את זה, זה באמת קצת לא הכי הגיוני...
תנסי לדחוף קיר למשל ואת לא מצליחה כי את דוחפת את הדיר כמו שהוא אותך כי מופעל לחץ משני הצדדים ולשניכם יש אותה המסה