האם כל חומר הבנוי ממולקולות זהות הוא בהכרח יסוד?

לא
למשל יהלום מורכב רק ממולקולות פחמן והוא לא יסוד
אוזון מורכב ממולקולות חמצן והוא לא יסוד

כן, משום שזאת ההגדרה של יסוד.
ואוזון הוא אכן יסוד, אם כי יהלום לא בהכרח יסוד משום שאין בטבע יהלום טהור.

לא
החומרים מתחלקים ל-שתי קבוצות
קבוצת התערובות וקבוצת היסודות והתרכובות

עכשיו שמתי לב שכתבת מולקולות ולא אטומים, אז לא.
חומר שמורכב מולקולות זהות שבנויות מאטומים שונים הוא תרכובת ולכן אם המולקולות זהות אז החומר הוא בהכרח לא תערובת אבל הוא לא בהכרח יסוד, מצטער על הבילבול.

לא